本所前身係日據時期台南地方法院北港出張所，位於北港廟後，今仁和路四十四號，專辦不動產登記事項，光復後於民國三十五年十一月一日正式成立，名為台南縣北港地政事務所，隸屬台南縣政府。民國三十九年十月因調整行政區域，遷址於本鎮民主路七十一號，正名為雲林縣北港地政事務所，改隸屬於雲林縣政府。原址係利用日據時期遺留之廳舍，因不敷使用，且為配合本鎮媽祖廟觀光計劃，原址擬改建觀光大樓，乃由雲林縣政府籌資，利用原空軍訓練基地之縣有土地於民國七十一年二月七日動工興建現有辦公大樓，所址位於本鎮文仁路二號。新所係一建築美侖美奐且設備完善之辦公大樓，完工後本所乃於七十二年八月一日遷入現址辦公迄今。於民國八十三年間內政部地政司基於國家基本三角網為各種測量之基礎，除預備測設七百個基本控制點作為基本網外，同時設立八個衛星追蹤站，以期此基本控制網達到最完善之設計，本所有幸雀屏中選為全省西部唯一設於地政事務所其中一站之衛星追蹤站。